Både havnen i Aalborg og hele Nordjylland går glip af vigtige udviklingsmidler til at forbedre infrastrukturen og skabe grønne transportløsninger. Det mener havnen i hvert fald selv.
Problemet er ifølge Port of Aalborg, at havnen ikke er kategoriseret som en indlandshavn, og derfor ikke har adgang til EU's store pulje af havneudviklingsmidler for indlandshavne. Det skyldes, at Limfjorden i EU-regi ikke er klassificeret som en indre vandvej.